侵華戰爭時期，日本人將掠得的北京猿人頭骨偷運回國，途中沉沒，成為一樁疑案。當年日本人將頭骨化石偷運回國，隱藏幾十年后，在和平環境下重新進行研究。他們將頭骨化石中的DNA殘片提取出來，進行培育，然后送入太空，據說這樣便可以憑借太空中的粒子幅射，使其蘊育成熟。不料，載著北京猿人胚胎的飛船失事，墜入海島，而北京猿人卻成功地誕生了。
　　而王祖賢扮演的中國美麗女間諜的使命就是將北京猿人偷運回國，從此便和日本科學家展開了明爭暗斗。最后，雙方不分輸贏，而是達成了共識：北京猿人不是任何一國的財富，他們屬于大自然。于是，猿人一家三口和一只同樣由基因技術復制出來的猛瑪象被放歸了自然。